Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK4

Cabp2, Calcium-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp2Q9JLK4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cabp2Q9JLK4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cabp2Q9JLK4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cabp2Q9JLK4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cabp2Q9JLK4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cabp2Q9JLK4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cabp2Q9JLK4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cabp2Q9JLK4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cabp2Q9JLK4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cabp2Q9JLK4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cabp2Q9JLK4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cabp2Q9JLK4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cabp2Q9JLK4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cabp2Q9JLK4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cabp2Q9JLK4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cabp2Q9JLK4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cabp2Q9JLK4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cabp2Q9JLK4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cabp2Q9JLK4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cabp2Q9JLK4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cabp2Q9JLK4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cabp2Q9JLK4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cabp2Q9JLK4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cabp2Q9JLK4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cabp2Q9JLK4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cabp2Q9JLK4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cabp2Q9JLK4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cabp2Q9JLK4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cabp2Q9JLK4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cabp2Q9JLK4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cabp2Q9JLK4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cabp2Q9JLK4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cabp2Q9JLK4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cabp2Q9JLK4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cabp2Q9JLK4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cabp2Q9JLK4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cabp2Q9JLK4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cabp2Q9JLK4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cabp2Q9JLK4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cabp2Q9JLK4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cabp2Q9JLK4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cabp2Q9JLK4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cabp2Q9JLK4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cabp2Q9JLK4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cabp2Q9JLK4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cabp2Q9JLK4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cabp2Q9JLK4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cabp2Q9JLK4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cabp2Q9JLK4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cabp2Q9JLK4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cabp2Q9JLK4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cabp2Q9JLK4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cabp2Q9JLK4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cabp2Q9JLK4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cabp2Q9JLK4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cabp2Q9JLK4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cabp2Q9JLK4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cabp2Q9JLK4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cabp2Q9JLK4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cabp2Q9JLK4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cabp2Q9JLK4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cabp2Q9JLK4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cabp2Q9JLK4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cabp2Q9JLK4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cabp2Q9JLK4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cabp2Q9JLK4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cabp2Q9JLK4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cabp2Q9JLK4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cabp2Q9JLK4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cabp2Q9JLK4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cabp2Q9JLK4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cabp2Q9JLK4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp2Q9JLK4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp2Q9JLK4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp2Q9JLK4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp2Q9JLK4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp2Q9JLK4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp2Q9JLK4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp2Q9JLK4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp2Q9JLK4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp2Q9JLK4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp2Q9JLK4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp2Q9JLK4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp2Q9JLK4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp2Q9JLK4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp2Q9JLK4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp2Q9JLK4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp2Q9JLK4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp2Q9JLK4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp2Q9JLK4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cabp2Q9JLK4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cabp2Q9JLK4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cabp2Q9JLK4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cabp2Q9JLK4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cabp2Q9JLK4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cabp2Q9JLK4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cabp2Q9JLK4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cabp2Q9JLK4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cabp2Q9JLK4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cabp2Q9JLK4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms