Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tlr5Q9JLF7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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