Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CubnQ9JLB4 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CubnQ9JLB4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CubnQ9JLB4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CubnQ9JLB4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CubnQ9JLB4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CubnQ9JLB4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CubnQ9JLB4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CubnQ9JLB4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CubnQ9JLB4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CubnQ9JLB4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CubnQ9JLB4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CubnQ9JLB4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CubnQ9JLB4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CubnQ9JLB4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CubnQ9JLB4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CubnQ9JLB4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CubnQ9JLB4 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CubnQ9JLB4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CubnQ9JLB4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CubnQ9JLB4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CubnQ9JLB4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CubnQ9JLB4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CubnQ9JLB4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CubnQ9JLB4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CubnQ9JLB4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CubnQ9JLB4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CubnQ9JLB4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CubnQ9JLB4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CubnQ9JLB4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CubnQ9JLB4 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CubnQ9JLB4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CubnQ9JLB4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CubnQ9JLB4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CubnQ9JLB4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CubnQ9JLB4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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