Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gde1Q9JL56 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gde1Q9JL56 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gde1Q9JL56 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gde1Q9JL56 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gde1Q9JL56 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gde1Q9JL56 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gde1Q9JL56 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gde1Q9JL56 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gde1Q9JL56 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gde1Q9JL56 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gde1Q9JL56 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gde1Q9JL56 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gde1Q9JL56 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gde1Q9JL56 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gde1Q9JL56 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gde1Q9JL56 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gde1Q9JL56 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gde1Q9JL56 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gde1Q9JL56 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gde1Q9JL56 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gde1Q9JL56 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gde1Q9JL56 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gde1Q9JL56 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gde1Q9JL56 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gde1Q9JL56 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gde1Q9JL56 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gde1Q9JL56 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gde1Q9JL56 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gde1Q9JL56 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gde1Q9JL56 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gde1Q9JL56 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gde1Q9JL56 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gde1Q9JL56 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gde1Q9JL56 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gde1Q9JL56 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gde1Q9JL56 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gde1Q9JL56 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gde1Q9JL56 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gde1Q9JL56 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gde1Q9JL56 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gde1Q9JL56 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gde1Q9JL56 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gde1Q9JL56 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gde1Q9JL56 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gde1Q9JL56 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gde1Q9JL56 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gde1Q9JL56 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gde1Q9JL56 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gde1Q9JL56 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gde1Q9JL56 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gde1Q9JL56 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gde1Q9JL56 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gde1Q9JL56 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gde1Q9JL56 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms