Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKW0

Arl6ip1, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip1Q9JKW0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms