Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyp39a1Q9JKJ9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms