Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trem1Q9JKE2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms