Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms