Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ybx3Q9JKB3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ybx3Q9JKB3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms