Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms