Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pard6bQ9JK83 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pard6bQ9JK83 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms