Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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