Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN2

Zfhx4, Zinc finger homeobox protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 3,550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfhx4Q9JJN2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfhx4Q9JJN2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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