Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Riox1Q9JJF3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms