Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smad9Q9JIW5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms