Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ercc6l2Q9JIM3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms