Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccl28Q9JIL2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccl28Q9JIL2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccl28Q9JIL2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccl28Q9JIL2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccl28Q9JIL2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccl28Q9JIL2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccl28Q9JIL2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccl28Q9JIL2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccl28Q9JIL2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccl28Q9JIL2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccl28Q9JIL2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccl28Q9JIL2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccl28Q9JIL2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccl28Q9JIL2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccl28Q9JIL2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccl28Q9JIL2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms