Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pus3Q9JI38 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Pus3Q9JI38 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms