Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHR9

Nrip2, Nuclear receptor-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip2Q9JHR9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nrip2Q9JHR9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrip2Q9JHR9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrip2Q9JHR9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms