Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmod3Q9JHJ0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms