Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tcirg1Q9JHF5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcirg1Q9JHF5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms