Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn19Q9ET38 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn19Q9ET38 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn19Q9ET38 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
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Cldn19Q9ET38 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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Cldn19Q9ET38 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn19Q9ET38 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn19Q9ET38 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn19Q9ET38 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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Cldn19Q9ET38 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn19Q9ET38 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn19Q9ET38 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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Cldn19Q9ET38 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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Cldn19Q9ET38 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn19Q9ET38 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn19Q9ET38 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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Cldn19Q9ET38 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn19Q9ET38 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn19Q9ET38 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
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Cldn19Q9ET38 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn19Q9ET38 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn19Q9ET38 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn19Q9ET38 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn19Q9ET38 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn19Q9ET38 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn19Q9ET38 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn19Q9ET38 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
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Cldn19Q9ET38 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn19Q9ET38 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
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Cldn19Q9ET38 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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Cldn19Q9ET38 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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Cldn19Q9ET38 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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Cldn19Q9ET38 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
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Cldn19Q9ET38 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn19Q9ET38 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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