Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
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Rb1cc1Q9ESK9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Rb1cc1Q9ESK9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Rb1cc1Q9ESK9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Rb1cc1Q9ESK9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
Rb1cc1Q9ESK9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Rb1cc1Q9ESK9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Rb1cc1Q9ESK9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Rb1cc1Q9ESK9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Rb1cc1Q9ESK9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Rb1cc1Q9ESK9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC31.39■■■□□ 2.61
Rb1cc1Q9ESK9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
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Rb1cc1Q9ESK9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
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Rb1cc1Q9ESK9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
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Rb1cc1Q9ESK9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
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Rb1cc1Q9ESK9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Rb1cc1Q9ESK9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
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Rb1cc1Q9ESK9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
Rb1cc1Q9ESK9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Rb1cc1Q9ESK9 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Rb1cc1Q9ESK9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Rb1cc1Q9ESK9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
Rb1cc1Q9ESK9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
Rb1cc1Q9ESK9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Rb1cc1Q9ESK9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Rb1cc1Q9ESK9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Rb1cc1Q9ESK9 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Rb1cc1Q9ESK9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Rb1cc1Q9ESK9 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Rb1cc1Q9ESK9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
Rb1cc1Q9ESK9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Rb1cc1Q9ESK9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Rb1cc1Q9ESK9 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Rb1cc1Q9ESK9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Rb1cc1Q9ESK9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
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