Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Usp29Q9ES63 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp29Q9ES63 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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