Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERV1

Mkrn2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn2Q9ERV1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mkrn2Q9ERV1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mkrn2Q9ERV1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mkrn2Q9ERV1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mkrn2Q9ERV1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mkrn2Q9ERV1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mkrn2Q9ERV1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mkrn2Q9ERV1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Mkrn2Q9ERV1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mkrn2Q9ERV1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mkrn2Q9ERV1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mkrn2Q9ERV1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mkrn2Q9ERV1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mkrn2Q9ERV1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mkrn2Q9ERV1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mkrn2Q9ERV1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mkrn2Q9ERV1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mkrn2Q9ERV1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mkrn2Q9ERV1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mkrn2Q9ERV1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mkrn2Q9ERV1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mkrn2Q9ERV1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mkrn2Q9ERV1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mkrn2Q9ERV1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mkrn2Q9ERV1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mkrn2Q9ERV1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mkrn2Q9ERV1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mkrn2Q9ERV1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mkrn2Q9ERV1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mkrn2Q9ERV1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mkrn2Q9ERV1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mkrn2Q9ERV1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mkrn2Q9ERV1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mkrn2Q9ERV1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mkrn2Q9ERV1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mkrn2Q9ERV1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mkrn2Q9ERV1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Mkrn2Q9ERV1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Mkrn2Q9ERV1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mkrn2Q9ERV1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mkrn2Q9ERV1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mkrn2Q9ERV1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mkrn2Q9ERV1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Mkrn2Q9ERV1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mkrn2Q9ERV1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mkrn2Q9ERV1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mkrn2Q9ERV1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mkrn2Q9ERV1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mkrn2Q9ERV1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mkrn2Q9ERV1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mkrn2Q9ERV1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mkrn2Q9ERV1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mkrn2Q9ERV1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mkrn2Q9ERV1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Mkrn2Q9ERV1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mkrn2Q9ERV1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mkrn2Q9ERV1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mkrn2Q9ERV1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mkrn2Q9ERV1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mkrn2Q9ERV1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mkrn2Q9ERV1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mkrn2Q9ERV1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mkrn2Q9ERV1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mkrn2Q9ERV1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mkrn2Q9ERV1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mkrn2Q9ERV1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mkrn2Q9ERV1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mkrn2Q9ERV1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mkrn2Q9ERV1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mkrn2Q9ERV1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mkrn2Q9ERV1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mkrn2Q9ERV1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mkrn2Q9ERV1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mkrn2Q9ERV1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mkrn2Q9ERV1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mkrn2Q9ERV1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mkrn2Q9ERV1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Mkrn2Q9ERV1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mkrn2Q9ERV1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mkrn2Q9ERV1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mkrn2Q9ERV1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mkrn2Q9ERV1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mkrn2Q9ERV1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mkrn2Q9ERV1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Mkrn2Q9ERV1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mkrn2Q9ERV1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mkrn2Q9ERV1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mkrn2Q9ERV1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mkrn2Q9ERV1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mkrn2Q9ERV1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mkrn2Q9ERV1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mkrn2Q9ERV1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mkrn2Q9ERV1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mkrn2Q9ERV1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mkrn2Q9ERV1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mkrn2Q9ERV1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mkrn2Q9ERV1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mkrn2Q9ERV1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mkrn2Q9ERV1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mkrn2Q9ERV1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms