Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn12Q9ER56 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms