Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER42

Barx1, Homeobox protein BarH-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx1Q9ER42 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Barx1Q9ER42 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Barx1Q9ER42 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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