Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ52

Vmn1r48, Vomeronasal type-1 receptor 48, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r48Q9EQ52 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r48Q9EQ52 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r48Q9EQ52 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r48Q9EQ52 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r48Q9EQ52 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r48Q9EQ52 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r48Q9EQ52 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r48Q9EQ52 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r48Q9EQ52 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r48Q9EQ52 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r48Q9EQ52 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r48Q9EQ52 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r48Q9EQ52 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r48Q9EQ52 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r48Q9EQ52 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r48Q9EQ52 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r48Q9EQ52 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r48Q9EQ52 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r48Q9EQ52 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r48Q9EQ52 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r48Q9EQ52 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r48Q9EQ52 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r48Q9EQ52 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r48Q9EQ52 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r48Q9EQ52 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r48Q9EQ52 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r48Q9EQ52 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r48Q9EQ52 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r48Q9EQ52 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r48Q9EQ52 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms