Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPS4

Vmn1r172, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r172Q9EPS4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r172Q9EPS4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r172Q9EPS4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r172Q9EPS4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r172Q9EPS4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r172Q9EPS4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r172Q9EPS4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r172Q9EPS4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r172Q9EPS4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r172Q9EPS4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r172Q9EPS4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r172Q9EPS4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r172Q9EPS4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r172Q9EPS4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r172Q9EPS4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r172Q9EPS4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r172Q9EPS4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r172Q9EPS4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r172Q9EPS4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r172Q9EPS4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r172Q9EPS4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r172Q9EPS4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r172Q9EPS4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r172Q9EPS4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r172Q9EPS4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r172Q9EPS4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r172Q9EPS4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r172Q9EPS4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r172Q9EPS4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r172Q9EPS4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r172Q9EPS4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r172Q9EPS4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r172Q9EPS4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r172Q9EPS4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r172Q9EPS4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms