Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL6

Mmp1b, Interstitial collagenase B, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp1bQ9EPL6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp1bQ9EPL6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms