Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP93

Vmn1r53, Vomeronasal type-1 receptor 53, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r53Q9EP93 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r53Q9EP93 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r53Q9EP93 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r53Q9EP93 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r53Q9EP93 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r53Q9EP93 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r53Q9EP93 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r53Q9EP93 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r53Q9EP93 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r53Q9EP93 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r53Q9EP93 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r53Q9EP93 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r53Q9EP93 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r53Q9EP93 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r53Q9EP93 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r53Q9EP93 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r53Q9EP93 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r53Q9EP93 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r53Q9EP93 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r53Q9EP93 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r53Q9EP93 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r53Q9EP93 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r53Q9EP93 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r53Q9EP93 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r53Q9EP93 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r53Q9EP93 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r53Q9EP93 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r53Q9EP93 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r53Q9EP93 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r53Q9EP93 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r53Q9EP93 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r53Q9EP93 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r53Q9EP93 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r53Q9EP93 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r53Q9EP93 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r53Q9EP93 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r53Q9EP93 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Vmn1r53Q9EP93 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r53Q9EP93 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r53Q9EP93 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r53Q9EP93 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r53Q9EP93 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r53Q9EP93 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r53Q9EP93 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r53Q9EP93 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r53Q9EP93 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r53Q9EP93 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r53Q9EP93 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r53Q9EP93 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r53Q9EP93 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r53Q9EP93 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r53Q9EP93 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r53Q9EP93 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r53Q9EP93 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r53Q9EP93 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r53Q9EP93 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r53Q9EP93 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r53Q9EP93 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r53Q9EP93 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r53Q9EP93 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r53Q9EP93 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r53Q9EP93 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r53Q9EP93 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r53Q9EP93 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r53Q9EP93 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r53Q9EP93 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r53Q9EP93 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r53Q9EP93 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r53Q9EP93 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r53Q9EP93 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r53Q9EP93 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r53Q9EP93 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r53Q9EP93 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r53Q9EP93 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r53Q9EP93 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r53Q9EP93 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r53Q9EP93 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r53Q9EP93 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r53Q9EP93 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r53Q9EP93 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r53Q9EP93 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r53Q9EP93 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r53Q9EP93 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r53Q9EP93 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r53Q9EP93 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r53Q9EP93 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r53Q9EP93 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r53Q9EP93 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r53Q9EP93 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r53Q9EP93 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r53Q9EP93 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r53Q9EP93 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r53Q9EP93 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r53Q9EP93 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r53Q9EP93 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r53Q9EP93 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r53Q9EP93 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r53Q9EP93 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r53Q9EP93 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r53Q9EP93 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms