Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP79

Vmn1r52, Vomeronasal type-1 receptor 52, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r52Q9EP79 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r52Q9EP79 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r52Q9EP79 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms