Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl4Q9DCU6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms