Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3fQ9DCH4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms