Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCF9

Ssr3, Translocon-associated protein subunit gamma, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr3Q9DCF9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms