Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Swt1Q9DBQ9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Swt1Q9DBQ9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms