Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrpraQ9DBG7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms