Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms