Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB38

Znf580, Zinc finger protein 580, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Znf580Q9DB38 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf580Q9DB38 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Znf580Q9DB38 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Znf580Q9DB38 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Znf580Q9DB38 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Znf580Q9DB38 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf580Q9DB38 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Znf580Q9DB38 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf580Q9DB38 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf580Q9DB38 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf580Q9DB38 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf580Q9DB38 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf580Q9DB38 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf580Q9DB38 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf580Q9DB38 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Znf580Q9DB38 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Znf580Q9DB38 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Znf580Q9DB38 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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