Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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