Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAP7

Asf1b, Histone chaperone ASF1B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asf1bQ9DAP7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Asf1bQ9DAP7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms