Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9DA42 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9DA42 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9DA42 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9DA42 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9DA42 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9DA42 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9DA42 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9DA42 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9DA42 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9DA42 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9DA42 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9DA42 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9DA42 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9DA42 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9DA42 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9DA42 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9DA42 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9DA42 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9DA42 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9DA42 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9DA42 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9DA42 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9DA42 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9DA42 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9DA42 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9DA42 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9DA42 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9DA42 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9DA42 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9DA42 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9DA42 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9DA42 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9DA42 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9DA42 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9DA42 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9DA42 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9DA42 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9DA42 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9DA42 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9DA42 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9DA42 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9DA42 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9DA42 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9DA42 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9DA42 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9DA42 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9DA42 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9DA42 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9DA42 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9DA42 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9DA42 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9DA42 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9DA42 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9DA42 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9DA42 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9DA42 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9DA42 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9DA42 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9DA42 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9DA42 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9DA42 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9DA42 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9DA42 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9DA42 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9DA42 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9DA42 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9DA42 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9DA42 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9DA42 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9DA42 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9DA42 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9DA42 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9DA42 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9DA42 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9DA42 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9DA42 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9DA42 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9DA42 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9DA42 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9DA42 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Q9DA42 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Q9DA42 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Q9DA42 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9DA42 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9DA42 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9DA42 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9DA42 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9DA42 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9DA42 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9DA42 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9DA42 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9DA42 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9DA42 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9DA42 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9DA42 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9DA42 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9DA42 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9DA42 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9DA42 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms