Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smco2Q9DA21 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms