Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Usp12Q9D9M2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Usp12Q9D9M2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Usp12Q9D9M2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Usp12Q9D9M2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp12Q9D9M2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Usp12Q9D9M2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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