Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Actrt1Q9D9J3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms