Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tvp23bQ9D8T4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms