Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rexo2Q9D8S4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rexo2Q9D8S4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rexo2Q9D8S4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rexo2Q9D8S4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rexo2Q9D8S4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rexo2Q9D8S4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rexo2Q9D8S4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rexo2Q9D8S4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rexo2Q9D8S4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rexo2Q9D8S4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rexo2Q9D8S4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rexo2Q9D8S4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rexo2Q9D8S4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rexo2Q9D8S4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rexo2Q9D8S4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rexo2Q9D8S4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rexo2Q9D8S4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rexo2Q9D8S4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rexo2Q9D8S4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rexo2Q9D8S4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rexo2Q9D8S4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rexo2Q9D8S4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rexo2Q9D8S4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rexo2Q9D8S4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rexo2Q9D8S4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rexo2Q9D8S4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rexo2Q9D8S4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rexo2Q9D8S4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rexo2Q9D8S4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rexo2Q9D8S4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rexo2Q9D8S4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rexo2Q9D8S4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rexo2Q9D8S4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rexo2Q9D8S4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rexo2Q9D8S4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rexo2Q9D8S4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rexo2Q9D8S4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rexo2Q9D8S4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rexo2Q9D8S4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rexo2Q9D8S4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rexo2Q9D8S4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rexo2Q9D8S4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rexo2Q9D8S4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rexo2Q9D8S4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rexo2Q9D8S4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rexo2Q9D8S4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rexo2Q9D8S4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rexo2Q9D8S4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rexo2Q9D8S4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rexo2Q9D8S4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rexo2Q9D8S4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms