Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9D8Q6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms