Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N6

Lin37, Protein lin-37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin37Q9D8N6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin37Q9D8N6 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin37Q9D8N6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin37Q9D8N6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin37Q9D8N6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin37Q9D8N6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin37Q9D8N6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin37Q9D8N6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin37Q9D8N6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin37Q9D8N6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin37Q9D8N6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin37Q9D8N6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin37Q9D8N6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin37Q9D8N6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin37Q9D8N6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin37Q9D8N6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin37Q9D8N6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin37Q9D8N6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin37Q9D8N6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin37Q9D8N6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin37Q9D8N6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin37Q9D8N6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin37Q9D8N6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin37Q9D8N6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lin37Q9D8N6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lin37Q9D8N6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lin37Q9D8N6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lin37Q9D8N6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lin37Q9D8N6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lin37Q9D8N6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lin37Q9D8N6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lin37Q9D8N6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lin37Q9D8N6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lin37Q9D8N6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lin37Q9D8N6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lin37Q9D8N6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lin37Q9D8N6 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lin37Q9D8N6 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lin37Q9D8N6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lin37Q9D8N6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lin37Q9D8N6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lin37Q9D8N6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lin37Q9D8N6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lin37Q9D8N6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lin37Q9D8N6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lin37Q9D8N6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lin37Q9D8N6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lin37Q9D8N6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lin37Q9D8N6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lin37Q9D8N6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lin37Q9D8N6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lin37Q9D8N6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lin37Q9D8N6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lin37Q9D8N6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms