Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F3

Slc52a2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a2Q9D8F3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc52a2Q9D8F3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc52a2Q9D8F3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc52a2Q9D8F3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc52a2Q9D8F3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc52a2Q9D8F3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc52a2Q9D8F3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc52a2Q9D8F3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc52a2Q9D8F3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc52a2Q9D8F3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc52a2Q9D8F3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc52a2Q9D8F3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc52a2Q9D8F3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc52a2Q9D8F3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc52a2Q9D8F3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc52a2Q9D8F3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc52a2Q9D8F3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc52a2Q9D8F3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc52a2Q9D8F3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc52a2Q9D8F3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc52a2Q9D8F3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc52a2Q9D8F3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc52a2Q9D8F3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc52a2Q9D8F3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc52a2Q9D8F3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc52a2Q9D8F3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc52a2Q9D8F3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc52a2Q9D8F3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc52a2Q9D8F3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc52a2Q9D8F3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc52a2Q9D8F3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc52a2Q9D8F3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc52a2Q9D8F3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc52a2Q9D8F3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc52a2Q9D8F3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc52a2Q9D8F3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc52a2Q9D8F3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc52a2Q9D8F3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc52a2Q9D8F3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc52a2Q9D8F3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc52a2Q9D8F3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc52a2Q9D8F3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc52a2Q9D8F3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc52a2Q9D8F3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc52a2Q9D8F3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc52a2Q9D8F3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc52a2Q9D8F3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc52a2Q9D8F3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc52a2Q9D8F3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc52a2Q9D8F3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc52a2Q9D8F3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc52a2Q9D8F3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc52a2Q9D8F3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc52a2Q9D8F3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc52a2Q9D8F3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc52a2Q9D8F3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc52a2Q9D8F3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Slc52a2Q9D8F3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Slc52a2Q9D8F3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Slc52a2Q9D8F3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Slc52a2Q9D8F3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Slc52a2Q9D8F3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc52a2Q9D8F3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc52a2Q9D8F3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc52a2Q9D8F3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc52a2Q9D8F3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc52a2Q9D8F3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc52a2Q9D8F3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc52a2Q9D8F3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc52a2Q9D8F3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc52a2Q9D8F3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc52a2Q9D8F3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc52a2Q9D8F3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc52a2Q9D8F3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc52a2Q9D8F3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc52a2Q9D8F3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc52a2Q9D8F3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc52a2Q9D8F3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc52a2Q9D8F3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc52a2Q9D8F3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc52a2Q9D8F3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc52a2Q9D8F3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc52a2Q9D8F3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc52a2Q9D8F3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc52a2Q9D8F3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc52a2Q9D8F3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc52a2Q9D8F3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc52a2Q9D8F3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc52a2Q9D8F3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc52a2Q9D8F3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc52a2Q9D8F3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc52a2Q9D8F3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc52a2Q9D8F3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc52a2Q9D8F3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc52a2Q9D8F3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc52a2Q9D8F3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc52a2Q9D8F3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc52a2Q9D8F3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc52a2Q9D8F3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc52a2Q9D8F3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms